小型秸秆颗粒机生产的颗粒燃料的原料主要是农作物，因此有人就提出疑问：宝贵的粮食来制造颗粒燃料不是浪费吗？制成颗粒燃料的农作物只要是指农作物的茎秆等废料，而非人们通常食用的果实。在最初接触颗粒燃料时，容易产生以下误区：

1）与粮争地的误区。小型秸秆颗粒机生产的原料，可以利用不宜种植农作物的荒地、坡地、改良后的盐碱地，还可利用休、闲土地，完全可以做到不与生产粮食争地。

2）与人争粮的误区。甜高梁、甘薯、木薯、秸杆、甘蔗都可以作为小型秸秆颗粒机生产颗粒燃料的原料。各种废油、油菜籽都可以用来生产生物柴油。生物质能将起到一个粮食安全平衡器的作用。

3）技术不成熟的误区。生物发酵技术，是我国生物技术中与国外差距最小的技术，燃料乙醇的技术已达到先进水平，生物柴油技术也已经进入研发产业化阶段，沼气技术已经应用多年并取得很大成绩，秸杆综合利用的技术也已取得了重大突破。秸秆颗粒机的改进可以降低成本，而且颗粒燃料比煤炭要安全，是一个非常大的能源。

4）生产成本高的误区。颗粒是成本较低的能源之一，生产过程安全，不破坏原料内的营养成分。